История Алатанинской школы сплетается из нитей судеб ее учеников и учителей, и вплетается в историю нашего села, района, республики и всей страны. В 1919 году в деревне Алатана открылась начальная школа. Первым учителем в ней был Махмуд. В 1941 году многие мужчины, в том числе и выпускники, ушли на войну защищать Родину. В 1949 году открылась семилетняя школа в здании клуба. В 1963 году после пожара был построен деревянный одноэтажный корпус. В 1966-1967 году на базе школы открылся филиал Михайловской средней школы, который затем получил статус самостоятельной средней школы. С этого момента школа стала называться Алатанинской средней школой. В 1973 году было построено двухэтажное деревянное здание школы. В 1986 году было построено двухэтажное кирпичное здание на 192 ученических места.
Директорами были:
Шарипов Асхат Нагимович (1957-1959гг.)
Касимов Шайхетдин Гидиятович (1959 -1978гг.)
Ризванов Марат Иншарович (1978-1980гг.)
Сафуганов Ринат Султанович (1980-1990гг.)
Куликова Александра Васильевна (1990-1992гг.)
Тимофеев Александр Анатольевич (1992-1999гг.)
Рамазанова Гульнур Шавкатовна (1999-2019гг.)
Сафуганов Айрат Ринатович (с 2019- по настоящее время)